5座车超载一人扣6分。
一、按照规定，驾驶小客车载客人数超过核定人数20%的，扣6分。
1、营运客车超过核定数的，一次记12分；营运客车数量超过核定数量不足20%的，一次记6分；营运客车、校车等载客汽车超过核定人数20%的，记3分。
2、客运车辆超过额定载客人数载客的，处200元以上500元以下罚款；超过额定乘客20%或者违规载货的，处500元以上2000元以下罚款。
3、机动车超过核定载质量的，处以200元以上500元以下罚款；超过核定载质量30%或者违规载客的，处500元以上2000元以下罚款。
5座车超载一人的处罚需视情况而定：
1、如果是驾驶非营运性质的5座车，超载一人，一次扣除3分；
2、如果是营运性质的5座车，则扣除6分，罚款200。
二、车辆超载的法律规定如下：
1、公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款。超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款；
2、货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款。超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。
总之，5座车超载一人的处罚需视情况而定。车辆超限超载有法律规定的认定标准，若违反相关法律规定，会面临罚款或其他处罚。车辆超载情节严重的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。
相关法规
《中华人民共和国道路交通安全法》
第九十二条 公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。
货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。
有前两款行为的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。
运输单位的车辆有本条第一款、第二款规定的情形，经处罚不改的，对直接负责的主管人员处二千元以上五千元以下罚款。
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