离婚时，如果夫妻双方对婚内共同财产、孩子的抚养权、抚养费、以及共同债务等问题都达成一致，在真实、自愿、公平的基础上可以协商离婚，签一份离婚协议双方签字后到民政局申请办理离婚登记，我国民法典规定，夫妻通过协议离婚时增加了一个为期30天的冷静期，也就是说，自从民政局受理离婚登记开始，30天内如果夫妻双方都没有异议，冷静期结束后，民政局给双方颁发离婚证，正式解除夫妻关系，如果在冷静期内一方不同意离婚的，可以向民政局请求撤回离婚申请。
如果夫妻双方离婚时协商无效，就只能选择诉讼离婚，一方向人民法院提起离婚诉讼，法院在受理时，如果查明双方感情确已破裂，已经无法挽回时，会依法判决。
法院在受理离婚案件时首先会进行调解;如果夫妻双方感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。如果符合下列情形之一，调解无效的，法院应当准予离婚：
在婚姻关系存续期间，夫妻一方跟别的异性登记结婚，或者跟婚外异性不以夫妻名义，在一起长久稳定的住在一起;
(2)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员;夫妻一方有暴力倾向，如男方存在殴打、限制女方自由等危害女方人身安全的恶劣行为时;
(3)有赌博、吸毒等恶习经一方劝导仍不知悔改的;如男方经常赌博不回家，对家庭生活不闻不问的;
(4)婚姻存续期间，由于生活琐事闹矛盾双方分开住，满两年以上的;这里北京婚姻律师再提醒一下：这里的分居是指，由于夫妻关系恶化，感情不和分居满两年的，而不是生活中常见的有的夫妻为了照顾上学的孩子、去外地打工等原因导致的分居，离婚时一定要注意。
(5)一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
(6)经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
生活中常常有人在咨询中问怎么提供分居两年的证据，离婚律师总结了几点，供大家作为参考：
1、双方感情不和，一方租的房屋租赁合同;
2、如果分居时双方签了分居协议的话也可以作为证据证明双方分居的事实(分居协议最好是书面的形式);
3、双方的微信聊天记录、短信等能证明双方感情不和分居的记录。
北京婚姻律师提醒大家：结婚后，如果夫妻之间产生矛盾，无法再共同经营这个家，感情已经恶化，不能挽回时，只能选择离婚来结束这段不行的婚姻生活时，由于人们缺乏对法律专业知识的认知，很多人在离婚时都无法保障自己的合法权益。
以上内容就是，夫妻分居两年能否协议离婚的全部解答，如您还有其他疑问，您可以咨询专业的离婚律师，帮助您争取更多的合法权益。