夫妻有两个孩子的，抚养权可以按照下列标准判决：
一、如果两个孩子都在两周岁以下的，可能会判决两个孩子都归女方抚养。
二、如果一个孩子在两周岁以下，另一个孩子在两周岁以上的，则可能判决两周岁以下的孩子由女方抚养，两周岁以上的孩子由男方抚养；如果法院认为两周岁以上的孩子归女方抚养更利于其健康成的，则也会判决两个孩子都归女方抚养。
三、如果两个孩子都在两周岁以上的，法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决孩子抚养权的归属；实践中可能会判决一人抚养一个孩子。
需要注意如果女方存在下列情况的，则即使孩子在两周岁以下抚养权也会判给男方：
（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；
（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；
（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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